| 主な所蔵品 | 点数 | 年代 | 所有者 | 備 考 |
| <歴史資料> | ||||
| 神保長住制札 | 1 | 戦国時代 | - | 射水市指定文化財 |
| 汐海家文書 | 10,645 | 近世・近代 | - | 射水市指定文化財 |
| 柴家文書 | 345 | 近世・近代 | - | 射水市指定文化財 |
| 野上家文書 | 378 | 近世・近代 | - | 射水市指定文化財 |
| 金木家文書 | 318 | 近世・近代 | - | 射水市指定文化財 |
| <民俗> | ||||
| 和船模型 | 1 | 近代 | - | 射水市指定文化財 |
| 船霊 | 2 | 近代 | - | 射水市指定文化財 |
| <工芸> | ||||
| 石黒宗麿の作品群 | 418 | 現代 | - | 重要無形文化財保持者（人間国宝） |
| <考古> | ||||
| 放生津城跡出土品 | 100 | 南北朝時代 〜戦国時代 |
- | （射水市指定史跡） |
| 主な寄託品 | 点数 | 年代 | 所有者 | 備 考 |
| <歴史資料> | ||||
| 石黒信由関係資料 | 3,765 | 江戸時代 | （財）高樹会 | 重要文化財 |
| 高樹文庫資料 | 8,506 | 江戸時代 | （財）高樹会 | 富山県指定文化財 |
| 塩問屋松屋文書 | 525 | 江戸時代 | 個人 | 射水市指定文化財 |
| <民俗> | ||||
| 火事場火消装束 | 30 | 江戸時代 | 個人 | 射水市指定文化財 |
| 聖観音石像 | 1 | 南北朝時代 | 阿弥陀寺 | 射水市指定文化財 |
| 放生津八幡宮築山神事の神面 | 5 | 室町時代 〜江戸時代初期 |
放生津八幡宮文化財保存会 | （富山県指定無形民俗文化財） |